Ульи, рамки (после удаления из них сотов), диафрагмы и другие деревянные предметы после механической очистки дезинфицируют двукратно с интервалом 1 час раствором, содержащим 10% перекиси водорода и 0,5% муравьиной кислоты, 10% -ным раствором однохлористого йода или раствором формальдегида, содержащим 15% формальдегида и 5% едкого натра (время дезинфекции — 4-6 часов), или просто моют 3%-ным раствором соды или едкого натра, а затем обжигают огнем паяльной лампы.

Медогонки и прочий металлический инвентарь обрабатывают в течение 6 часов раствором формальдегида (15% формальдегида и 5% едкого натра). После дезинфекции все предметы тщательно промывают водой и просушивают.

В целях предупреждения перицистисмикоза на пасеках содержат сильные, хорошо утепленные в холодную дождливую погоду семьи. Сами пасеки размещают на возвышенных, хорошо аэрируемых солнечных участках, в сухих местах с медоносной растительностью. Ранней весной (еще в период зимовки семей на воле и особенно в зимовнике) следует усилить вентиляцию в ульях и заменить влажные подушки.